Musicien français, né à Paris, Pierre Cogen est initié au chant grégorien, aux polyphonies vocales et à l’accompagnement à l’orgue dans le cadre d’une maîtrise, la Schola du Petit Séminaire de Paris. Sa formation musicale de base est tout à fait semblable à celle des musiciens de l’Ancien Régime. Ses études secondaires générales terminées, Pierre Cogen suit un cycle d’études supérieures de philosophie et entreprend parallèlement une formation musicale complète, tant théorique que pratique, en orgue et improvisation, en pédagogie musicale aussi bien qu’en harmonie, contrepoint et fugue à l’École César Frank et à la Schola Cantorum, sanctionnée par de nombreux diplômes. Ses maîtres sont Jean Langlais, Edouard Souberbielle, André Fleury, Pierre Cochereau, Yvonne Desportes…
Professeur d’éducation musicale et de chant choral, d’écriture, d’orgue et d’improvisation, Pierre Cogen a consacré une part importante de ses activités à l’enseignement et à la direction de chœurs. Il enseigne dans plusieurs établissements parisiens, particulièrement à l’École Alsacienne de Paris et au Conservatoire Maurice Ravel de Levallois.
Organiste liturgique dès l’âge de 14 ans, Pierre Cogen exerce cette fonction pendant près de 50 ans, d’abord dans les séminaires parisiens de Conflans et d’Issy, puis à l’Église Sainte-Geneviève des Grandes Carrières. Enfin, il est nommé en 1976 organiste du grand orgue de la Basilique Sainte-Clotilde de Paris, poste qu’il conserve jusqu’à sa retraite en 1994. Il se rattache ainsi à la tradition musicale de Sainte-Clotilde, tradition particulièrement illustrée par César Franck, Charles Tournemire et Jean Langlais.
Organiste concertiste, il a donné de nombreux concerts, tant en France qu’en Europe. Proposant des programmes étendus et variés, il est très souvent sollicité pour interpréter plus spécialement les œuvres de ses prédécesseurs à Sainte-Clotilde et leur consacre plusieurs enregistrements.
Compositeur, son catalogue comporte essentiellement des œuvres pour orgue.